2003年10月30日，国务院《关于同意云南省撤销思茅地区设立地级思茅市的批复》（国函[2003]113号），同意云南省撤销思茅地区，设立思茅市。原县级思茅市行政区域为翠云区行政区域。思茅市辖普洱哈尼族彝族自治县、墨江哈尼族自治县、景东彝族自治县、镇沅彝族哈尼族拉祜族自治县、景谷傣族彝族自治县、江城哈尼族彝族自治县、孟连傣族拉祜族佤族自治县、澜沧拉祜族自治县、西盟佤族自治县和新设立的翠云区。2004年4月17日，思茅撤地设市庆祝大会在思茅万人体育馆隆重举行。   2006年1月20日，云南省人民政府《关于调整思茅市十个县区部分乡镇行政区划的批复》批准，翠云区撤销云仙彝族乡和震东乡，设立新的云仙彝族乡，辖原云仙彝族乡和震东乡行政区域范围。普洱哈尼族彝族自治县撤销把边乡，其行政区域并入磨黑镇；撤销凤阳乡，其行政区域并入宁洱镇。墨江哈尼族自治县撤销碧溪乡、双龙乡和忠爱桥乡，将原碧溪乡、双龙乡和忠爱桥乡的曼平、曼嘎、新联3个村委会所辖行政区域并入联珠镇，并将原忠爱桥乡的丙蚌、回龙、民兴3个村委会划归通关镇。景谷傣族彝族自治县撤销钟山乡，其行政区域并入威远镇；撤销边江乡，其行政区域并入永平镇。景东彝族自治县撤销永秀乡，其行政区域并入大朝山东镇；撤销者后乡，其行政区域并入文井镇。镇沅彝族哈尼族拉祜族自治县撤销三章田乡和者东乡，设立者东镇，辖原者东乡和三章田乡行政区域范围；撤销里崴乡，其行政区域并入勐大镇。江城哈尼族彝族自治县撤销红疆乡，其行政区域并入勐烈镇。孟连傣族拉祜族佤族自治县撤销南雅乡，其行政区域并入娜允镇。澜沧拉祜族自治县撤销勐朗镇、东朗哈尼族乡和谦迈乡，将东朗乡与勐朗镇合并，设置勐朗镇，并将谦迈乡看马山、布老、包麦地3个村委会划归勐朗镇；撤销糯扎渡乡，设立糯扎渡镇，并将谦迈乡竜山、谦迈、落水洞3个村委会划归糯扎渡镇；撤销新城乡，其行政区域并入谦六彝族乡。西盟佤族自治县撤销西盟镇和莫窝乡，设立勐卡镇，辖原西盟镇和莫窝乡行政区域范围。   2007年1月21日，国务院《关于同意云南省思茅市及相关县区更名的批复》（国函[2007]8号），同意思茅市更名（恢复）为普洱市，普洱哈尼族彝族自治县更名为宁洱哈尼族彝族自治县，思茅市翠云区更名为普洱市思茅区。2月16日，云南省人民政府发出《关于思茅市及相关县区更名的通知》；3月8日，思茅市人民政府转发《云南省人民政府关于思茅市及相关县区更名的通知》；4月8日，第八届中国普洱茶节、第二届全球普洱茶嘉年华会、云南省第二届普洱茶交易会、思茅市恢复为普洱市庆典活动在思茅隆重举行。普洱市辖思茅区和宁洱哈尼族彝族自治县、墨江哈尼族自治县、景东彝族自治县、镇沅彝族哈尼族拉祜族自治县、景谷傣族彝族自治县、江城哈尼族彝族自治县、孟连傣族拉祜族佤族自治县、澜沧拉祜族自治县、西盟佤族自治县。至此，普洱市辖1区9县，103个乡镇（其中镇30个，乡61个，民族自治乡12个），居民委员会36个，村民委员会994个。